Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chmp4cQ9D7F7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Chmp4cQ9D7F7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Chmp4cQ9D7F7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Chmp4cQ9D7F7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Chmp4cQ9D7F7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp4cQ9D7F7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp4cQ9D7F7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp4cQ9D7F7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp4cQ9D7F7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp4cQ9D7F7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp4cQ9D7F7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp4cQ9D7F7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp4cQ9D7F7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp4cQ9D7F7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp4cQ9D7F7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp4cQ9D7F7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp4cQ9D7F7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp4cQ9D7F7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp4cQ9D7F7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp4cQ9D7F7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp4cQ9D7F7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp4cQ9D7F7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp4cQ9D7F7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chmp4cQ9D7F7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chmp4cQ9D7F7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chmp4cQ9D7F7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chmp4cQ9D7F7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chmp4cQ9D7F7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chmp4cQ9D7F7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chmp4cQ9D7F7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chmp4cQ9D7F7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chmp4cQ9D7F7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chmp4cQ9D7F7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chmp4cQ9D7F7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chmp4cQ9D7F7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chmp4cQ9D7F7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chmp4cQ9D7F7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chmp4cQ9D7F7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chmp4cQ9D7F7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chmp4cQ9D7F7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chmp4cQ9D7F7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chmp4cQ9D7F7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Chmp4cQ9D7F7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chmp4cQ9D7F7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chmp4cQ9D7F7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms