Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tubb4aQ9D6F9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tubb4aQ9D6F9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tubb4aQ9D6F9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tubb4aQ9D6F9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tubb4aQ9D6F9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tubb4aQ9D6F9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tubb4aQ9D6F9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tubb4aQ9D6F9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubb4aQ9D6F9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubb4aQ9D6F9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubb4aQ9D6F9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubb4aQ9D6F9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubb4aQ9D6F9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubb4aQ9D6F9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubb4aQ9D6F9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubb4aQ9D6F9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubb4aQ9D6F9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubb4aQ9D6F9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubb4aQ9D6F9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubb4aQ9D6F9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubb4aQ9D6F9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubb4aQ9D6F9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms