Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc39Q9D5Y1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc39Q9D5Y1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc39Q9D5Y1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc39Q9D5Y1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms