Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lpcat2bQ9D5U0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lpcat2bQ9D5U0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms