Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930449I24RikQ9D5E3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930449I24RikQ9D5E3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930449I24RikQ9D5E3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930449I24RikQ9D5E3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930449I24RikQ9D5E3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930449I24RikQ9D5E3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930449I24RikQ9D5E3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
4930449I24RikQ9D5E3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms