Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ubxn11Q9D572 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn11Q9D572 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn11Q9D572 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.3 ms