Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc130Q9D516 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc130Q9D516 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms