Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms