Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C1

Lmntd1, Lamin tail domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd1Q9D4C1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lmntd1Q9D4C1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmntd1Q9D4C1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmntd1Q9D4C1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmntd1Q9D4C1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmntd1Q9D4C1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmntd1Q9D4C1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmntd1Q9D4C1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmntd1Q9D4C1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmntd1Q9D4C1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmntd1Q9D4C1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmntd1Q9D4C1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmntd1Q9D4C1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmntd1Q9D4C1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmntd1Q9D4C1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmntd1Q9D4C1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmntd1Q9D4C1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmntd1Q9D4C1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmntd1Q9D4C1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmntd1Q9D4C1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmntd1Q9D4C1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmntd1Q9D4C1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmntd1Q9D4C1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmntd1Q9D4C1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmntd1Q9D4C1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmntd1Q9D4C1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmntd1Q9D4C1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmntd1Q9D4C1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmntd1Q9D4C1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmntd1Q9D4C1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmntd1Q9D4C1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmntd1Q9D4C1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmntd1Q9D4C1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmntd1Q9D4C1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmntd1Q9D4C1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmntd1Q9D4C1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmntd1Q9D4C1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmntd1Q9D4C1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmntd1Q9D4C1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmntd1Q9D4C1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmntd1Q9D4C1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmntd1Q9D4C1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmntd1Q9D4C1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmntd1Q9D4C1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmntd1Q9D4C1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmntd1Q9D4C1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmntd1Q9D4C1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lmntd1Q9D4C1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms