Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Syce1Q9D495 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syce1Q9D495 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syce1Q9D495 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syce1Q9D495 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syce1Q9D495 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syce1Q9D495 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syce1Q9D495 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syce1Q9D495 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syce1Q9D495 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syce1Q9D495 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Syce1Q9D495 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syce1Q9D495 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syce1Q9D495 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syce1Q9D495 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syce1Q9D495 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syce1Q9D495 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Syce1Q9D495 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syce1Q9D495 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syce1Q9D495 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syce1Q9D495 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syce1Q9D495 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syce1Q9D495 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms