Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sohlh2Q9D489 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms