Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D454 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D454 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D454 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D454 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D454 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D454 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D454 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D454 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D454 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D454 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D454 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D454 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9D454 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9D454 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9D454 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9D454 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9D454 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9D454 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9D454 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9D454 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9D454 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9D454 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9D454 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9D454 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q9D454 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D454 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D454 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D454 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D454 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D454 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D454 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D454 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D454 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D454 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D454 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D454 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D454 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D454 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D454 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D454 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D454 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D454 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D454 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D454 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D454 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D454 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D454 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D454 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D454 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D454 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D454 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D454 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D454 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D454 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D454 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D454 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D454 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D454 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D454 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9D454 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9D454 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9D454 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9D454 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9D454 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9D454 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9D454 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9D454 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D454 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D454 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D454 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D454 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D454 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D454 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D454 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D454 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D454 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D454 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D454 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D454 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D454 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D454 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9D454 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9D454 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9D454 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9D454 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9D454 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9D454 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9D454 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9D454 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9D454 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9D454 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9D454 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Q9D454 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D454 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D454 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D454 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D454 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D454 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D454 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms