Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpn3Q9D3W4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpn3Q9D3W4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms