Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Stag1Q9D3E6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stag1Q9D3E6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stag1Q9D3E6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stag1Q9D3E6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stag1Q9D3E6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stag1Q9D3E6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stag1Q9D3E6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stag1Q9D3E6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stag1Q9D3E6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stag1Q9D3E6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stag1Q9D3E6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stag1Q9D3E6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stag1Q9D3E6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stag1Q9D3E6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stag1Q9D3E6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stag1Q9D3E6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Stag1Q9D3E6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stag1Q9D3E6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stag1Q9D3E6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stag1Q9D3E6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stag1Q9D3E6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stag1Q9D3E6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stag1Q9D3E6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Stag1Q9D3E6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stag1Q9D3E6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stag1Q9D3E6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stag1Q9D3E6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stag1Q9D3E6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stag1Q9D3E6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stag1Q9D3E6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stag1Q9D3E6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stag1Q9D3E6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stag1Q9D3E6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stag1Q9D3E6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stag1Q9D3E6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stag1Q9D3E6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stag1Q9D3E6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Stag1Q9D3E6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stag1Q9D3E6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stag1Q9D3E6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stag1Q9D3E6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stag1Q9D3E6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stag1Q9D3E6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stag1Q9D3E6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stag1Q9D3E6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stag1Q9D3E6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stag1Q9D3E6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stag1Q9D3E6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stag1Q9D3E6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stag1Q9D3E6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stag1Q9D3E6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Stag1Q9D3E6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stag1Q9D3E6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stag1Q9D3E6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stag1Q9D3E6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stag1Q9D3E6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stag1Q9D3E6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Stag1Q9D3E6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Stag1Q9D3E6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stag1Q9D3E6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stag1Q9D3E6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stag1Q9D3E6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stag1Q9D3E6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stag1Q9D3E6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stag1Q9D3E6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stag1Q9D3E6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stag1Q9D3E6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stag1Q9D3E6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stag1Q9D3E6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stag1Q9D3E6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stag1Q9D3E6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stag1Q9D3E6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stag1Q9D3E6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stag1Q9D3E6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stag1Q9D3E6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stag1Q9D3E6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stag1Q9D3E6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stag1Q9D3E6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stag1Q9D3E6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stag1Q9D3E6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stag1Q9D3E6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stag1Q9D3E6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stag1Q9D3E6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stag1Q9D3E6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stag1Q9D3E6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stag1Q9D3E6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stag1Q9D3E6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Stag1Q9D3E6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stag1Q9D3E6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms