Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rufy3Q9D394 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rufy3Q9D394 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rufy3Q9D394 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rufy3Q9D394 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rufy3Q9D394 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rufy3Q9D394 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rufy3Q9D394 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Rufy3Q9D394 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Rufy3Q9D394 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rufy3Q9D394 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Rufy3Q9D394 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rufy3Q9D394 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rufy3Q9D394 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rufy3Q9D394 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rufy3Q9D394 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rufy3Q9D394 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rufy3Q9D394 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rufy3Q9D394 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rufy3Q9D394 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rufy3Q9D394 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rufy3Q9D394 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rufy3Q9D394 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rufy3Q9D394 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rufy3Q9D394 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rufy3Q9D394 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rufy3Q9D394 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rufy3Q9D394 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rufy3Q9D394 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rufy3Q9D394 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rufy3Q9D394 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rufy3Q9D394 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rufy3Q9D394 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rufy3Q9D394 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rufy3Q9D394 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rufy3Q9D394 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rufy3Q9D394 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rufy3Q9D394 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rufy3Q9D394 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rufy3Q9D394 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rufy3Q9D394 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rufy3Q9D394 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Rufy3Q9D394 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rufy3Q9D394 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms