Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q9D2Q3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9D2Q3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms