Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nol3Q9D1X0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nol3Q9D1X0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms