Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J1

Necap2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necap2Q9D1J1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Necap2Q9D1J1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms