Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmbr1lQ9D1E5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmbr1lQ9D1E5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmbr1lQ9D1E5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmbr1lQ9D1E5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmbr1lQ9D1E5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmbr1lQ9D1E5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmbr1lQ9D1E5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmbr1lQ9D1E5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmbr1lQ9D1E5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmbr1lQ9D1E5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmbr1lQ9D1E5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmbr1lQ9D1E5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmbr1lQ9D1E5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmbr1lQ9D1E5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmbr1lQ9D1E5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmbr1lQ9D1E5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmbr1lQ9D1E5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmbr1lQ9D1E5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmbr1lQ9D1E5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmbr1lQ9D1E5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmbr1lQ9D1E5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmbr1lQ9D1E5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmbr1lQ9D1E5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmbr1lQ9D1E5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmbr1lQ9D1E5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmbr1lQ9D1E5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmbr1lQ9D1E5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmbr1lQ9D1E5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmbr1lQ9D1E5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmbr1lQ9D1E5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmbr1lQ9D1E5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmbr1lQ9D1E5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmbr1lQ9D1E5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms