Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hddc3Q9D114 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Hddc3Q9D114 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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