Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M2

Cdca7, Cell division cycle-associated protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca7Q9D0M2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdca7Q9D0M2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdca7Q9D0M2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms