Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
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