Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F4

Nkap, NF-kappa-B-activating protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkapQ9D0F4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NkapQ9D0F4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NkapQ9D0F4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NkapQ9D0F4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NkapQ9D0F4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NkapQ9D0F4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NkapQ9D0F4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NkapQ9D0F4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NkapQ9D0F4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NkapQ9D0F4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NkapQ9D0F4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NkapQ9D0F4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NkapQ9D0F4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NkapQ9D0F4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NkapQ9D0F4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NkapQ9D0F4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NkapQ9D0F4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NkapQ9D0F4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NkapQ9D0F4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NkapQ9D0F4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NkapQ9D0F4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NkapQ9D0F4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NkapQ9D0F4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NkapQ9D0F4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NkapQ9D0F4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NkapQ9D0F4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NkapQ9D0F4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NkapQ9D0F4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NkapQ9D0F4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NkapQ9D0F4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NkapQ9D0F4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NkapQ9D0F4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NkapQ9D0F4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NkapQ9D0F4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NkapQ9D0F4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NkapQ9D0F4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NkapQ9D0F4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NkapQ9D0F4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms