Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisa9Q9CZN4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms