Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYC3

Tmem39a, Transmembrane protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39aQ9CYC3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem39aQ9CYC3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms