Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Utp23Q9CX11 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms