Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pin4Q9CWW6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pin4Q9CWW6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pin4Q9CWW6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pin4Q9CWW6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pin4Q9CWW6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pin4Q9CWW6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pin4Q9CWW6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pin4Q9CWW6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pin4Q9CWW6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pin4Q9CWW6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pin4Q9CWW6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pin4Q9CWW6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pin4Q9CWW6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pin4Q9CWW6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pin4Q9CWW6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pin4Q9CWW6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pin4Q9CWW6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pin4Q9CWW6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pin4Q9CWW6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pin4Q9CWW6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pin4Q9CWW6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pin4Q9CWW6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pin4Q9CWW6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pin4Q9CWW6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pin4Q9CWW6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pin4Q9CWW6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pin4Q9CWW6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pin4Q9CWW6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pin4Q9CWW6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pin4Q9CWW6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pin4Q9CWW6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms