Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWR2

Smyd3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd3Q9CWR2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Smyd3Q9CWR2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 297.2 ms