Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhobtb3Q9CTN4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhobtb3Q9CTN4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhobtb3Q9CTN4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms