Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA4

Msmo1, Methylsterol monooxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msmo1Q9CRA4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msmo1Q9CRA4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msmo1Q9CRA4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msmo1Q9CRA4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msmo1Q9CRA4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msmo1Q9CRA4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msmo1Q9CRA4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msmo1Q9CRA4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msmo1Q9CRA4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msmo1Q9CRA4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msmo1Q9CRA4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msmo1Q9CRA4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msmo1Q9CRA4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msmo1Q9CRA4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msmo1Q9CRA4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msmo1Q9CRA4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msmo1Q9CRA4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msmo1Q9CRA4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msmo1Q9CRA4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msmo1Q9CRA4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msmo1Q9CRA4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msmo1Q9CRA4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msmo1Q9CRA4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Msmo1Q9CRA4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msmo1Q9CRA4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msmo1Q9CRA4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msmo1Q9CRA4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msmo1Q9CRA4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Msmo1Q9CRA4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msmo1Q9CRA4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msmo1Q9CRA4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msmo1Q9CRA4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msmo1Q9CRA4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msmo1Q9CRA4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msmo1Q9CRA4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msmo1Q9CRA4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msmo1Q9CRA4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msmo1Q9CRA4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msmo1Q9CRA4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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