Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim8Q9CQQ0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms