Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms