Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ndufb9Q9CQJ8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndufb9Q9CQJ8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndufb9Q9CQJ8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms