Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms