Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE6

Asf1a, Histone chaperone ASF1A, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1aQ9CQE6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Asf1aQ9CQE6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Asf1aQ9CQE6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Asf1aQ9CQE6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Asf1aQ9CQE6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Asf1aQ9CQE6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Asf1aQ9CQE6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Asf1aQ9CQE6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Asf1aQ9CQE6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Asf1aQ9CQE6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Asf1aQ9CQE6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Asf1aQ9CQE6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Asf1aQ9CQE6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Asf1aQ9CQE6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Asf1aQ9CQE6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Asf1aQ9CQE6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Asf1aQ9CQE6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Asf1aQ9CQE6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Asf1aQ9CQE6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Asf1aQ9CQE6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Asf1aQ9CQE6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Asf1aQ9CQE6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Asf1aQ9CQE6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Asf1aQ9CQE6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Asf1aQ9CQE6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Asf1aQ9CQE6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Asf1aQ9CQE6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Asf1aQ9CQE6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Asf1aQ9CQE6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Asf1aQ9CQE6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Asf1aQ9CQE6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Asf1aQ9CQE6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Asf1aQ9CQE6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Asf1aQ9CQE6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Asf1aQ9CQE6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Asf1aQ9CQE6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Asf1aQ9CQE6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Asf1aQ9CQE6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Asf1aQ9CQE6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms