Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms