Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp6v0e1Q9CQD8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6v0e1Q9CQD8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms