Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Pkp2Q9CQ73 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms