Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ70

H2afb1, Histone H2A-Bbd type 1, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afb1Q9CQ70 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afb1Q9CQ70 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afb1Q9CQ70 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afb1Q9CQ70 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afb1Q9CQ70 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afb1Q9CQ70 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afb1Q9CQ70 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afb1Q9CQ70 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afb1Q9CQ70 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afb1Q9CQ70 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afb1Q9CQ70 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afb1Q9CQ70 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afb1Q9CQ70 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afb1Q9CQ70 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afb1Q9CQ70 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afb1Q9CQ70 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afb1Q9CQ70 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afb1Q9CQ70 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afb1Q9CQ70 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afb1Q9CQ70 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afb1Q9CQ70 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afb1Q9CQ70 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afb1Q9CQ70 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afb1Q9CQ70 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afb1Q9CQ70 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afb1Q9CQ70 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afb1Q9CQ70 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2afb1Q9CQ70 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2afb1Q9CQ70 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2afb1Q9CQ70 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2afb1Q9CQ70 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2afb1Q9CQ70 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2afb1Q9CQ70 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
H2afb1Q9CQ70 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2afb1Q9CQ70 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afb1Q9CQ70 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms