Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnaseh2cQ9CQ18 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnaseh2cQ9CQ18 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnaseh2cQ9CQ18 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnaseh2cQ9CQ18 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnaseh2cQ9CQ18 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnaseh2cQ9CQ18 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnaseh2cQ9CQ18 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnaseh2cQ9CQ18 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnaseh2cQ9CQ18 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnaseh2cQ9CQ18 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnaseh2cQ9CQ18 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnaseh2cQ9CQ18 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnaseh2cQ9CQ18 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnaseh2cQ9CQ18 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnaseh2cQ9CQ18 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnaseh2cQ9CQ18 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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