Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt88Q9CPR6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms