Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpl17Q9CPR4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpl17Q9CPR4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpl17Q9CPR4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpl17Q9CPR4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpl17Q9CPR4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpl17Q9CPR4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpl17Q9CPR4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpl17Q9CPR4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpl17Q9CPR4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpl17Q9CPR4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl17Q9CPR4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl17Q9CPR4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl17Q9CPR4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl17Q9CPR4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl17Q9CPR4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl17Q9CPR4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl17Q9CPR4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl17Q9CPR4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl17Q9CPR4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl17Q9CPR4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl17Q9CPR4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl17Q9CPR4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl17Q9CPR4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl17Q9CPR4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl17Q9CPR4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl17Q9CPR4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl17Q9CPR4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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