Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf8Q99PV0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms