Protein–RNA interactions for Protein: Q99PT3

Ino80b, INO80 complex subunit B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80bQ99PT3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ino80bQ99PT3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms