Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms