Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GpnmbQ99P91 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms