Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rtn4Q99P72 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms