Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gtf2ird2Q99NI3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2ird2Q99NI3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2ird2Q99NI3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2ird2Q99NI3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2ird2Q99NI3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2ird2Q99NI3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2ird2Q99NI3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2ird2Q99NI3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2ird2Q99NI3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2ird2Q99NI3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2ird2Q99NI3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2ird2Q99NI3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2ird2Q99NI3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2ird2Q99NI3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2ird2Q99NI3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2ird2Q99NI3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2ird2Q99NI3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2ird2Q99NI3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2ird2Q99NI3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2ird2Q99NI3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2ird2Q99NI3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2ird2Q99NI3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2ird2Q99NI3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2ird2Q99NI3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2ird2Q99NI3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2ird2Q99NI3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2ird2Q99NI3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2ird2Q99NI3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2ird2Q99NI3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2ird2Q99NI3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2ird2Q99NI3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2ird2Q99NI3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2ird2Q99NI3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2ird2Q99NI3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2ird2Q99NI3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2ird2Q99NI3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2ird2Q99NI3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2ird2Q99NI3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2ird2Q99NI3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2ird2Q99NI3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2ird2Q99NI3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2ird2Q99NI3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2ird2Q99NI3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2ird2Q99NI3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2ird2Q99NI3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2ird2Q99NI3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms