Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms