Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll1Q99NC0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms